本病的確切病因尚不完全明了，與以下一些因素有關：

　　1.遺傳因素：文獻報道有同胞姐妹得病，在同家族中可有無癥狀患者，或患其他結締組織病、高丙球蛋白血癥者。親屬中抗核抗體的陽性率也較高。組織相容性抗原如HLA-A1B、DR3、HLA-DR2、C4a與本病相關，而且抗RO/SSA抗體與DR3陽性的新生兒狼瘡密切相關，這些均提示本病存在遺傳傾向。

　　2.感染因素：病毒感染，尤其是慢病毒感染在本病發(fā)病的意義，已引起普遍重視。狼瘡患兒可出現血清抗病毒抗體滴度增高（如麻疹、風疹、副流感及EB病毒等）。患兒體內可發(fā)現病毒包涵體，核衣殼等。病毒感染系直接因素，或系發(fā)病誘因，有待進一步探討。 醫(yī)學教育網收集整理

　　3.自身免疫：在系統(tǒng)性紅斑狼瘡患兒體內可測出多種自身抗體，如抗細胞核抗體（ANA）、抗核糖核酸抗體（RNA）、抗脫氧核糖核酸抗體（DNA）、抗可提取核抗原（ENA）抗體、抗細胞漿抗體、抗細胞間質抗體、抗紅細胞抗體、抗白細胞抗體、抗血小板抗體、抗丙種球蛋白抗體（類風濕因子）等。通過免疫熒光檢查，在受損或無病變的皮膚血管壁、表皮和真皮的連接處、腎小球血管壁及其他受累組織，可見到IgG、IgA、IgM、C3、C4及抗原抗體復合物的沉積，同時血清補體水平降低。

　　4.其他發(fā)病因素：本病多見于女性，因此內分泌的影響亦應考慮。日光照射可使病情加重。此外，一些藥物也可引起本病，如青霉素、磺胺類、異煙肼、對氨基水楊酸、呋喃叮、普魯卡因酰胺、青霉胺、肼苯達嗪、甲基多巴、巰甲丙脯酸、氯丙嗪、苯妥英鈉、撲癇酮、三甲雙酮等。又稱類狼瘡綜合征。停藥后癥狀可消失。

　　目前認為本病系由上述諸因素誘發(fā)的自身免疫性疾病。各種自身抗體與相應的抗原結合形成可溶性免疫復合物，在補體參與下，沉積于靶器官，從而產生全身血管及相應組織器官的炎性反應，造成組織病理損害。