第二章 核酸的結(jié)構(gòu)與功能
一、核酸的分子組成:基本組成單位是核苷酸,而核苷酸則由堿基、戊糖和磷酸三種成分連接而成。
兩類核酸:脫氧核糖核酸(DNA),存在于細(xì)胞核和線粒體內(nèi)。
核糖核酸(RNA),存在于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核內(nèi)。
1、堿基:
NH2
NH2 O CH3 O O
O O O NH2
胞嘧啶 胸腺嘧啶 尿嘧啶 鳥嘌呤 腺嘌呤
嘌呤和嘧啶環(huán)中均含有共軛雙鍵,因此對波長260nm左右的紫外光有較強(qiáng)吸收,這一重要的理化性質(zhì)被用于對核酸、核苷酸、核苷及堿基進(jìn)行定性定量分析。
2、戊糖:DNA分子的核苷酸的 糖是β-D-2-脫氧核糖,RNA中為β-D-核糖。
3、磷酸:生物體內(nèi)多數(shù)核苷酸的磷酸基團(tuán)位于核糖的第五位碳原子上。
二、核酸的一級結(jié)構(gòu)
核苷酸在多肽鏈上的排列順序?yàn)楹怂岬囊患壗Y(jié)構(gòu),核苷酸之間通過3′,5′磷酸二酯鍵連接。
三、DNA的空間結(jié)構(gòu)與功能
1、DNA的二級結(jié)構(gòu)
DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)是核酸的二級結(jié)構(gòu)。雙螺旋的骨架由 糖和磷酸基構(gòu)成,兩股鏈之間的堿基互補(bǔ)配對,是遺傳信息傳遞者,DNA半保留復(fù)制的基礎(chǔ),結(jié)構(gòu)要點(diǎn):
a.DNA是一反向平行的互補(bǔ)雙鏈結(jié)構(gòu) 親水的脫氧核糖基和磷酸基骨架位于雙鏈的外側(cè),而堿基位于內(nèi)側(cè),堿基之間以氫鍵相結(jié)合,其中,腺嘌呤始終與胸腺嘧啶配對,形成兩個(gè)氫鍵,鳥嘌呤始終與胞嘧啶配對,形成三個(gè)氫鍵。
b.DNA是右手螺旋結(jié)構(gòu) 螺旋直徑為2nm。每旋轉(zhuǎn)一周包含了10個(gè)堿基,每個(gè)堿基的旋轉(zhuǎn)角度為36度。螺距為3.4nm,每個(gè)堿基平面之間的距離為0.34nm。
c.DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的維系 橫向靠互補(bǔ)堿基的氫鍵維系,縱向則靠堿基平面間的疏水性堆積力維持,尤以后者為重要。
2、DNA的三級結(jié)構(gòu)
三級結(jié)構(gòu)是在雙螺旋基礎(chǔ)上進(jìn)一步扭曲形成超螺旋,使體積壓縮。在真核生物細(xì)胞核內(nèi),DNA三級結(jié)構(gòu)與一組組蛋白共同組成核小體。在核小體的基礎(chǔ)上,DNA鏈經(jīng)反復(fù)折疊形成染色體。
3、功能
DNA的基本功能就是作為生物遺傳信息復(fù)制的模板和基因轉(zhuǎn)錄的模板,它是生命遺傳繁殖的物質(zhì)基礎(chǔ),也是個(gè)體生命活動(dòng)的基礎(chǔ)。
DNA中的核糖和磷酸構(gòu)成的分子骨架是沒有差別的,不同區(qū)段的DNA分子只是堿基的排列順序不同。
四、RNA的空間結(jié)構(gòu)與功能
DNA是遺傳信息的載體,而遺傳作用是由蛋白質(zhì)功能來體現(xiàn)的,在兩者之間RNA起著中介作用。其種類繁多,分子較小,一般以單鏈存在,可有局部二級結(jié)構(gòu),各類RNA在遺傳信息表達(dá)為氨基酸序列過程中發(fā)揮不同作用。如:
名 稱 功 能
核蛋白體RNA (rRNA) 核蛋白體組成成分
信使RNA (mRNA) 蛋白質(zhì)合成模板
轉(zhuǎn)運(yùn)RNA (tRNA) 轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸
不均一核RNA (HnRNA) 成熟mRNA的前體
小核RNA (SnRNA) 參與HnRNA的剪接、轉(zhuǎn)運(yùn)
小核仁RNA (SnoRNA) rRNA的加工和修飾
1、信使RNA(半衰期最短)
1)hnRNA為mRNA的初級產(chǎn)物,經(jīng)過剪接切除內(nèi)含子,拼接外顯子,成為成熟的mRNA并移位到細(xì)胞質(zhì)
2)大多數(shù)的真核mRNA在轉(zhuǎn)錄后5′末端加上一個(gè)7-甲基鳥嘌呤及三磷酸鳥苷帽子,帽子結(jié)構(gòu)在mRNA作為模板翻譯成蛋白質(zhì)的過程中具有促進(jìn)核蛋白體與mRNA的結(jié)合,加速翻譯起始速度的作用,同時(shí)可以增強(qiáng)mRNA的穩(wěn)定性。3′末端多了一個(gè)多聚腺苷酸尾巴,可能與mRNA從核內(nèi)向胞質(zhì)的轉(zhuǎn)位及mRNA的穩(wěn)定性有關(guān)。
3)功能是把核內(nèi)DNA的堿基順序,按照堿基互補(bǔ)的原則,抄錄并轉(zhuǎn)送至胞質(zhì),以決定蛋白質(zhì)合成的氨基酸排列順序。mRNA分子上每3個(gè)核苷酸為一組,決定肽鏈上某一個(gè)氨基酸,為三聯(lián)體密碼。
2、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(分子量最?。?
1)tRNA分子中含有10%~20%稀有堿基,包括雙氫尿嘧啶,假尿嘧啶和甲基化的嘌呤等。
2)二級結(jié)構(gòu)為三葉草形,位于左右兩側(cè)的環(huán)狀結(jié)構(gòu)分別稱為DHU環(huán)和Tψ環(huán),位于下方的環(huán)叫作反密碼環(huán)。反密碼環(huán)中間的3個(gè)堿基為反密碼子,與mRNA上相應(yīng)的三聯(lián)體密碼子形成堿基互補(bǔ)。所有tRNA3′末端均有相同的CCA-OH結(jié)構(gòu)。
3)三級結(jié)構(gòu)為倒L型。
4)功能是在細(xì)胞蛋白質(zhì)合成過程中作為各種氨基酸的戴本并將其轉(zhuǎn)呈給mRNA。
3、核蛋白體RNA(含量最多)
1)原核生物的rRNA的小亞基為16S,大亞基為5S、23S;真核生物的rRNA的小亞基為18S,大亞基為5S、5.8S、28S。真核生物的18SrRNA的二級結(jié)構(gòu)呈花狀。
2)rRNA與核糖體蛋白共同構(gòu)成核糖體,它是蛋白質(zhì)合成機(jī)器--核蛋白體的組成成分,參與蛋白質(zhì)的合成。
4、核酶:某些RNA 分子本身具有自我催化能,可以完成rRNA的剪接。這種具有催化作用的RNA稱為核酶。
五、核酸的理化性質(zhì)
1、DNA的變性
在某些理化因素作用下,如加熱,DNA分子互補(bǔ)堿基對之間的氫鍵斷裂,使DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)松散,變成單鏈,即為變性。監(jiān)測是否發(fā)生變性的一個(gè)最常用的指標(biāo)是DNA在紫外區(qū)260nm波長處的吸光值變化。解鏈過程中,吸光值增加,并與解鏈程度有一定的比例關(guān)系,稱為DNA的增色效應(yīng)。紫外光吸收值達(dá)到最大值的50%時(shí)的溫度稱為DNA的解鏈溫度(Tm),一種DNA分子的Tm值大小與其所含堿基中的G+C比例相關(guān),G+C比例越高,Tm值越高。
2、DNA的復(fù)性和雜交
變性DNA在適當(dāng)條件下,兩條互補(bǔ)鏈可重新恢復(fù)天然的雙螺旋構(gòu)象,這一現(xiàn)象稱為復(fù)性,其過程為退火,產(chǎn)生減色效應(yīng)。不同來源的核酸變性后,合并一起復(fù)性,只要這些核苷酸序列可以形成堿基互補(bǔ)配對,就會形成雜化雙鏈,這一過程為雜交。雜交可發(fā)生于DNA-DNA之間,RNA-RNA之間以及RNA-DNA之間。
六、核酸酶(注意與核酶區(qū)別)
指所有可以水解核酸的酶,在細(xì)胞內(nèi)催化核酸的降解??煞譃镈NA酶和RNA酶;外切酶和內(nèi)切酶;其中一部分具有嚴(yán)格的序列依賴性,稱為限制性內(nèi)切酶。