如果急性腎盂腎炎診斷、治療及時，則很少出現(xiàn)并發(fā)癥。并發(fā)于有潛在腎臟病或尿路畸形的急性腎盂腎炎的預后相對較差，而且致病菌常有耐藥性，如不去除腎結石，尤其是合并感染的結石，否則腎盂腎炎難以控制。并發(fā)于尿路梗阻的感染也很難治愈，常演變?yōu)槁赃^程，并可導致菌血癥。

　　急性腎盂腎炎最嚴重的并發(fā)癥是中毒性休克。產氣型腎盂腎炎是一種很少見但可致命的腎盂腎炎，通常見于糖尿病患者，由致病菌（常是大腸桿菌的某一菌株）釋放氣體進入感染組織所致。

　　在得到充分治療后，又無其他腎臟疾病或尿路畸形，急性腎盂腎炎通常可痊愈，并不引起腎臟瘢痕或持續(xù)性腎臟損害，相反在腎臟未完全發(fā)育成熟的嬰幼兒，尤其是并發(fā)于腎臟疾病或尿路畸形的急性腎盂腎炎，醫(yī)學`教育網搜集整理常引起持續(xù)腎臟損害和瘢痕。