蛋白質(zhì)功能：

蛋白質(zhì)是細(xì)胞中的主要功能分子。除了特定類別的RNA，大多數(shù)的其他生物分子都需要蛋白質(zhì)來調(diào)控。蛋白質(zhì)也是細(xì)胞中含量最為豐富的分子之一；例如，蛋白質(zhì)占大腸桿菌細(xì)胞干重的一半，而其他大分子如DNA和RNA則只分別占3%和20%.在一個(gè)特定細(xì)胞或細(xì)胞類型中表達(dá)的所有蛋白被稱為對應(yīng)細(xì)胞的蛋白質(zhì)組。

蛋白質(zhì)能夠在細(xì)胞中發(fā)揮多種多樣的功能，涵蓋了細(xì)胞生命活動(dòng)的各個(gè)方面：發(fā)揮催化作用的酶；參與生物體內(nèi)的新陳代謝的調(diào)劑作用，如胰島素；一些蛋白質(zhì)具有運(yùn)輸代謝物質(zhì)的作用，如離子泵和血紅蛋白；發(fā)揮儲(chǔ)存作用，如植物種子中的大量蛋白質(zhì)，就是用來萌發(fā)時(shí)的儲(chǔ)備；許多結(jié)構(gòu)蛋白被用于細(xì)胞骨架等的形成，如肌球蛋白；還有免疫、細(xì)胞分化、細(xì)胞凋亡等過程中都有大量蛋白質(zhì)參與。

蛋白質(zhì)功能發(fā)揮的關(guān)鍵在于能夠特異性地并且以不同的親和力與其他各類分子，包括蛋白質(zhì)分子結(jié)合。蛋白質(zhì)結(jié)合其他分子的區(qū)域被稱為結(jié)合位點(diǎn)，而結(jié)合位點(diǎn)常常是從蛋白質(zhì)分子表面下陷的一個(gè)“口袋”；而結(jié)合能力與蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)密切相關(guān)，因?yàn)榻Y(jié)構(gòu)決定了結(jié)合位點(diǎn)的形狀和化學(xué)性質(zhì)（即結(jié)合位點(diǎn)周圍的氨基酸殘基的側(cè)鏈的化學(xué)性質(zhì)）。蛋白質(zhì)結(jié)合的緊密性和特異性可以非常高；例如，核糖核酸酶抑制蛋白可以與人的血管促生蛋白angiogenin以亞飛摩爾（sub-femtomolar，即1 M）angiogenin在兩棲動(dòng)物中的同源蛋白抗腫瘤核糖核酸酶（onconase）。非常微小的化學(xué)結(jié)構(gòu)變化，如在結(jié)合位點(diǎn)的某一殘基側(cè)鏈上添加一個(gè)甲基基團(tuán)，有時(shí)就可以幾乎完全破壞結(jié)合；例如，氨酰tRNA合成酶可以分辨?zhèn)孺溄Y(jié)構(gòu)非常類似的纈氨酸和異亮氨酸，而這兩種氨基酸的差別就在于異亮氨酸的側(cè)鏈多出一個(gè)甲基。相同的蛋白質(zhì)分子結(jié)合在一起就可形成同源寡聚體或多聚體，有些多聚體可以形成纖維；而這些形成纖維的蛋白質(zhì)往往是結(jié)構(gòu)蛋白，它們在單體狀態(tài)下是球蛋白，通過自結(jié)合來形成剛性的纖維。蛋白-蛋白相互作用可以調(diào)控酶的活性和細(xì)胞周期中的各種進(jìn)程，并可以使大型的蛋白質(zhì)復(fù)合物得以形成，這樣可以將參與同一生物學(xué)功能的分子結(jié)合到一起，從而提高其工作效率；而結(jié)合所誘導(dǎo)的蛋白構(gòu)象變化對于復(fù)雜的信號(hào)傳導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建也是必不可少的。還有一些蛋白質(zhì)（如膜蛋白）可以結(jié)合或者插入到細(xì)胞膜中。