三大方法研究病因，均要先形成病因假設(shè)，然后再加以驗(yàn)證。流行病學(xué)形成的病因假設(shè)（說）是根據(jù)自己的、別人的經(jīng)驗(yàn)，疾病的自然史，已知的影響因素等而形成。在形成病因假設(shè)時(shí)，一般可遵循下列途徑（MacMahon等）。

1.求同法（method ofagreement）如果多種不同情況與某種疾病的存在有聯(lián)系，而在這多種情況均有一個(gè)共同的因素，則這個(gè)因素很可能為該病的病因。如氟斑牙患病率高的地區(qū)，飲水氟含量高，而患病率低處則飲水氟含量低。飲水氟含量高則可能為氟斑牙的病因。

2.求異法（method ofdifference）如果有A、B兩種情況，某病的發(fā)病率在A顯著高于在B，在A有某因素（F），在B沒有該因素，則F很可能是該病的病因。如肺癌發(fā)病率在吸煙者顯著高于在不吸煙者，說明吸煙可能是肺癌的病因醫(yī)`學(xué)教育網(wǎng)搜集整理。

3.共變法（method ofconcomitant variation）當(dāng)某個(gè)因素（F）出現(xiàn)的頻度或強(qiáng)度發(fā)生變化時(shí)，該病發(fā)生的頻率與強(qiáng)度也變化，則F很可能是該病的病因。如海豹肢畸形（phocomelia）隨反應(yīng)停（thalidomide）上市量的增減而增減。在溫州地區(qū)研究發(fā)現(xiàn)“散發(fā)性腦炎”的發(fā)病數(shù)，隨四咪唑和左旋咪唑上市量而變化，從而懷疑該藥物與“散發(fā)性腦炎”的發(fā)生有關(guān)。

4.類推法（method of analogy）當(dāng)一種疾病的分布與另外一種病因已清楚的疾病的分布相似時(shí)，則這兩種病可能有共同的病因。如前文所述河北省1963年流行的“不明熱”被判斷為鉤端螺旋體病，就是根據(jù)共分布特點(diǎn)而作。

除上述四種方法外，如果一種疾病有多種可疑的病因，而其中多種已被排除，僅余一種可能時(shí)，則此因素是該病的病因的可能性就大大增加。