餐后立即服用本品，生物利用度最高，口服后3—4小時(shí)后血藥濃度達(dá)峰值，血漿中清除呈雙相性，終末半衰期為1—1.5天。長(zhǎng)期給藥1—2周達(dá)穩(wěn)定狀態(tài)。在服藥后3—4小時(shí)，伊曲康唑穩(wěn)態(tài)血藥濃度分別是：0.4μg/ml(100mg每日一次)，1.1μg/ml(200mg每日一次)和2.0μg/ml(200mg每日二次)。本品血漿蛋白結(jié)合率為99.8%。全血濃度為血漿濃度的60%。在富含角蛋白的組織中，尤其是皮膚中的濃度比血漿濃度高4倍，而藥物清除是與表皮再生過程有關(guān)，連續(xù)用藥四周后停藥，7天后已不能測(cè)到藥物的血藥濃度。但皮膚中藥物仍可保持治療濃度以上達(dá)2—4周。開始治療1周后，在甲角質(zhì)中就可以測(cè)到伊曲康唑，3個(gè)月療程結(jié)束后，其藥物濃度仍至少存在6個(gè)月的時(shí)間。它同樣也存在于皮膚中，在汗液中也少量存在。伊曲康唑同時(shí)也集中地分布在易于受到真菌感染的部位。在肺、腎臟、肝臟、骨骼、胃、脾臟和肌肉中的濃度比相應(yīng)的血漿濃度高2—3倍。

在陰道組織中治療濃度持續(xù)時(shí)間是：200mg每日一次治療3天，可維持2天；200mg每日二次治療1天則維持3天。本品主要在肝中代謝，產(chǎn)生大量代謝產(chǎn)物。其中之一是羥基化伊曲康唑，體外研究發(fā)現(xiàn)其抗真菌活性與本品相似，生物分析法測(cè)得抗真菌藥物水平約為高壓液相色譜分析本品水平的3倍。經(jīng)糞排泄的原型藥約為所用劑量的3—18%，經(jīng)腎排泄的原型藥則低于所用劑量的0.03%，大約35%是作為代謝物在一周內(nèi)經(jīng)尿排泄。