HAV經(jīng)口感染后首先在腸道中繁殖，進(jìn)入血液后經(jīng)過短暫的病毒血癥，持續(xù)7-10天，使肝細(xì)胞受損。然而在動物或者人體組織中培養(yǎng)HAV時，未見其殺傷肝細(xì)胞使其破碎的作用。甲肝的發(fā)病機(jī)制不清，但是與肝臟免疫作用特別是細(xì)胞免疫作用相關(guān)。HAV可從肝細(xì)胞經(jīng)膽汁進(jìn)入腸道排出體外。因此，可從糞便中檢出HAV顆粒加以確診，在潛伏期或黃疸期的傳染性最強(qiáng)。

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