中國藥科大學藥物代謝動力學重點實驗室是在國家藥品監(jiān)督管理局藥物代謝動力學和生物藥劑學重點實驗室基礎上組建起來的。1992年被衛(wèi)生部指定為藥物代謝動力學和制劑人體生物利用度全國九個測試單位之一；1993年被原國家醫(yī)藥管理局批準為南京藥物代謝動力學和生物藥劑學重點實驗室。

1.2001年與南京市第一醫(yī)院共同被批準為國家藥品臨床研究基地；同年江蘇省科技廳、教育廳和中國藥科大學共同投資1035 萬元建設江蘇省藥物代謝動力學重點實驗室。

2.2003年作為全國十二所高等院校及科研院所的牽頭單位，承擔科技部“863”重大專項“臨床前藥物代謝動力學關鍵技術及平臺” 建設。

3.2003年9月，和日本島津制作所（香港）有限公司合作成立中國藥科大學－島津分析測試中心，進一步加強了實驗室的技術力量。