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南京大學醫(yī)學院的前身為中央大學醫(yī)學院，創(chuàng)建于1935年，1949年解放后改名為南京大學醫(yī)學院，1951年劃歸部隊系統(tǒng)，1987年經(jīng)教育部（原國家教委）批準重建，成為教育部直屬的第一所綜合性大學七年制醫(yī)學院。本院辦學方針是小規(guī)模、研究型、國際化，目標是培養(yǎng)未來醫(yī)學領軍人才，辦學理念和人才培養(yǎng)獨具特色�，F(xiàn)設臨床醫(yī)學、基礎醫(yī)學和口腔醫(yī)學三個專業(yè)，學制七年。有臨床醫(yī)學和基礎醫(yī)學二個一級學科碩士點及口腔臨床醫(yī)學一個二級學科碩士點，有生理學、內科學、外科學三個博士點和博士后流動站，其中普通外科學為國家重點學科。培養(yǎng)臨床醫(yī)學、基礎醫(yī)學和口腔醫(yī)學碩士和博士研究生。

以南京鼓樓醫(yī)院、南京軍區(qū)南京總醫(yī)院（金陵醫(yī)院）和南京口腔醫(yī)院作為附屬醫(yī)院，并以南京市各�？漆t(yī)院作為教學醫(yī)院，師資力量雄厚，現(xiàn)有中國工程院院士3人，博士生導師42人，教授124人，副教授179人。教學和科研成果顯著，曾獲得1996年教育部科技進步三等獎，1997年江蘇省教學成果一等獎和國家級教學成果二等獎， 1998年教育部科技進步三等獎， 1999年教育部科技進步三等獎，醫(yī)'學教育網(wǎng)|整理2000年中國高�？茖W技術二等獎，2002年度教育部提名國家科學技術獎一等獎和二等獎，2003年度教育部提名國家科學技術獎二等獎，2005年江蘇省教學成果一等獎，2008年教育部科技進步一等獎和自然科學二等獎。

憑借南京大學雄厚的自然科學基礎，濃郁的學術和人文氛圍，本院尤其注重加強學生的基礎理論、創(chuàng)新思維及科研能力和人文素質的培養(yǎng)，教學內容反映現(xiàn)代水平，并開設大量與現(xiàn)代醫(yī)學理論和臨床有關的選修課，使學生既具有廣博而堅實的生命科學和自然科學基礎，又掌握現(xiàn)代醫(yī)學理論和必要的臨床知識與實踐機能。

國際交流頻繁，與澳大利亞西澳大學醫(yī)學院、香港中文大學醫(yī)學院簽署學生交流協(xié)議，每年遴選優(yōu)秀學生赴上述大學醫(yī)學院進行為期3月和5周的交流。

除了學校的各類獎、助學金外，本院專設有“吳階平基金會優(yōu)秀貧困大學生助學專項基金”和“校友助學專項基金”等助學金，資助品學兼優(yōu)、家境貧寒的學生完成學業(yè)；還專設有“香港孫明杰基金會威爾曼優(yōu)秀研究生獎學金”，獎勵優(yōu)秀研究生。

學生順利完成學業(yè)，可獲得碩士學位，成績優(yōu)秀者可八年一貫，直接攻讀博士學位。

建院二十二年來，南京大學醫(yī)學院已培養(yǎng)十五屆畢業(yè)生，其中博士202名，碩士830名。這些畢業(yè)生極大多數(shù)在全國各大城市的三級甲等醫(yī)院中從事臨床工作，在工作中都有出色的表現(xiàn)，其中一部分在業(yè)務上已有所建樹或成為所在單位的骨干。用人單位在評價南京大學醫(yī)學院的畢業(yè)生時一致認為：該院畢業(yè)生基礎扎實、思維敏捷、知識面寬、外語好、計算機能力強，有較強的研究能力和創(chuàng)新能力，并十分關注醫(yī)學發(fā)展的前沿動態(tài)，在醫(yī)學臨床和研究領域有很強的競爭力。