醫(yī)學(xué)信息檢索的主要途徑包括主題詞檢索、分類檢索、關(guān)鍵詞（或自由詞）檢索及其它途徑檢索。

（一）主題詞檢索

主題詞檢索是根據(jù)標引人員按照規(guī)范詞表標引出的主題詞進行檢索。其優(yōu)點是能滿足特性檢索要求，專指性強；能適應(yīng)新興學(xué)科及多學(xué)科文獻檢索，只要根據(jù)新學(xué)科的出現(xiàn)、發(fā)展及多學(xué)科的需要，隨時增加主題詞，就能快速檢出所需文獻。其缺點是主題詞選擇必須準確，否則無法進行查找；由于主題詞的規(guī)范性，因此輸入的主題詞必須完全正確，因此每次使用需要查找主題詞表較費時間。目前國內(nèi)外采用主題詞檢索的數(shù)據(jù)庫其使用的主題詞表均具主題詞檢索和分類檢索的特點，因而也可適應(yīng)檢索范圍大、內(nèi)容廣的課題。

（二）分類檢索

分類號檢索是根據(jù)按一定規(guī)則編排的分類表進行檢索。其優(yōu)點是能滿足族性檢索的要求，便于查全某一學(xué)科或某一專業(yè)的文獻；易于擴大或縮小檢索范圍，擴大時可取上位類，縮小時可取下位類。

（三）關(guān)鍵詞（或自由詞）檢索

關(guān)鍵詞（或自由詞）檢索的最大優(yōu)點是詞語不必規(guī)范化，用戶可根據(jù)自己的需要，選擇熟悉的詞語進行檢索，不用特意記憶或事先查找詞匯，比較方便。其缺點是容易漏檢，因而使用這種途徑進行檢索時，必須同時考慮多個同義詞、近義詞，以減少漏檢。

（四）其它途徑檢索

許多醫(yī)學(xué)的分支學(xué)科根據(jù)自身的不同需求編制了一些特殊的索引，為用戶提供獨特的檢索途徑。如化學(xué)數(shù)據(jù)庫的分子式索引，生物學(xué)數(shù)據(jù)庫的屬種索引等。其優(yōu)點是方便了專業(yè)用戶的檢索。其缺點是掌握起來比較困難。