日本一区二区免费色色|久久亚洲欧美日本精品|欧美日韩综合一区|日本TS人妖在线专区

<button id="mykye"><table id="mykye"></table></button>
  • 
    
    <noframes id="mykye">
  • <cite id="mykye"></cite>

    醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)

    切換欄目
    當(dāng)前位置:醫(yī)學(xué)教育網(wǎng) 報(bào)錯(cuò)頁(yè)面

    您可能輸錯(cuò)了網(wǎng)址,或該網(wǎng)頁(yè)已被刪除或移動(dòng),您還可以:

    返回上一頁(yè)返回首頁(yè)網(wǎng)站地圖

    推薦閱讀
    > 正文
    RSS | 地圖 | 最新

    PloS ONE:RNA-Seq技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)

    2012-09-05 15:17  來(lái)源:醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)    打印 | 收藏 |
    字號(hào)

    | |

        摘要:RNA-Seq可進(jìn)行全基因組水平的基因表達(dá)差異研究,具有定量更準(zhǔn)確、可重復(fù)性更高、檢測(cè)范圍更廣、分析更可靠等特點(diǎn)。除了分析基因表達(dá)水平,RNA-Seq還能發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本、SNP、剪接變體,并提供等位基因特異的基因表達(dá)。對(duì)于RNA-Seq的優(yōu)缺點(diǎn),Helicos BioSciences的研究人員在《PloS ONE》上做了清晰闡述。

        一直以來(lái),研究人員都很有興趣了解細(xì)胞在各種不同狀態(tài)下的基因表達(dá)差異,并開發(fā)出多種方法,來(lái)不斷提高靈敏度和增加通量;虮磉_(dá)芯片是近年來(lái)較多采用的方法,但它如今卻碰上了一個(gè)強(qiáng)勁對(duì)手——RNA-Seq.

        RNA-Seq可進(jìn)行全基因組水平的基因表達(dá)差異研究,具有定量更準(zhǔn)確、可重復(fù)性更高、檢測(cè)范圍更廣、分析更可靠等特點(diǎn)。除了分析基因表達(dá)水平,RNA-Seq還能發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本、SNP、剪接變體,并提供等位基因特異的基因表達(dá)。

        RNA-Seq的動(dòng)態(tài)范圍更廣,且假陽(yáng)性可能更小,這意味著RNA-Seq的數(shù)據(jù)重復(fù)性應(yīng)當(dāng)比芯片要高。RNA-Seq能夠檢測(cè)樣品中的所有RNA,這對(duì)于鑒定細(xì)胞的新穎轉(zhuǎn)錄本來(lái)說(shuō)是個(gè)優(yōu)點(diǎn),但同時(shí)缺點(diǎn)在于,它檢測(cè)了總的RNA,而細(xì)胞中很大一部分RNA都來(lái)自核糖體和線粒體。這限制了其他RNA的讀取數(shù)量以及這些RNA表達(dá)水平的準(zhǔn)確性。因此,polyA RNA選擇和核糖體RNA去除等方法被開發(fā)出來(lái),以便解決這個(gè)問(wèn)題。

        然而,這些分離方法有可能會(huì)引入潛在誤差,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。因此,第三代測(cè)序公司Helicos BioSciences的研究人員對(duì)操作方法修改后可能發(fā)生哪些差異進(jìn)行了研究,文章發(fā)表在最近一期的《PloS ONE》上。

        他們認(rèn)為,對(duì)于研究人員來(lái)說(shuō),必須了解以下幾點(diǎn):技術(shù)差異如何影響結(jié)果的質(zhì)量和可解釋性,操作方法如何引入潛在誤差,RNA的來(lái)源如何影響轉(zhuǎn)錄檢測(cè),以及所有這些差異如何影響得到的結(jié)論。

        Helicos BioSciences公司的研究人員使用了多個(gè)人RNA樣品,來(lái)評(píng)估RNA片段化、RNA分離、cDNA合成,單個(gè)以及多個(gè)標(biāo)簽計(jì)算。盡管采用polyA RNA選擇的操作方法得到了最多的非核糖體讀取,并能夠最精確測(cè)定編碼轉(zhuǎn)錄本,但研究人員發(fā)現(xiàn)這種方法只能檢測(cè)人細(xì)胞中的一部分非核糖體RNA.

        polyA RNA排除了數(shù)千個(gè)注釋的轉(zhuǎn)錄本以及更多未注釋的轉(zhuǎn)錄本,使得轉(zhuǎn)錄組查看不完全。而核糖體去除的RNA則提供了一個(gè)更經(jīng)濟(jì)的方法,來(lái)生成完整的轉(zhuǎn)錄組覆蓋。與多個(gè)標(biāo)簽相比,利用單個(gè)標(biāo)簽的表達(dá)測(cè)定具有評(píng)估基因表達(dá)和檢測(cè)短RNA的優(yōu)勢(shì)。

        這項(xiàng)工作有望幫助研究人員在分析基因表達(dá)時(shí)選擇適當(dāng)?shù)漠a(chǎn)品。

    會(huì) 搜
    特別推薦
    醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)醫(yī)學(xué)書店
    • 名師編寫
    • 凝聚要點(diǎn)
    • 針對(duì)性強(qiáng)
    • 覆蓋面廣
    • 解答詳細(xì)
    • 質(zhì)量可靠
    • 一書在手
    • 夢(mèng)想成真
    網(wǎng)絡(luò)課堂
    40多類,1000多門輔導(dǎo)課程

    1、凡本網(wǎng)注明“來(lái)源:醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)”的所有作品,版權(quán)均屬醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)所有,未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、鏈接、轉(zhuǎn)貼或以其他方式使用;已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)的,應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用,且必須注明“來(lái)源:醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其法律責(zé)任。

    2、本網(wǎng)部分資料為網(wǎng)上搜集轉(zhuǎn)載,均盡力標(biāo)明作者和出處。對(duì)于本網(wǎng)刊載作品涉及版權(quán)等問(wèn)題的,請(qǐng)作者與本網(wǎng)站聯(lián)系,本網(wǎng)站核實(shí)確認(rèn)后會(huì)盡快予以處理。
      本網(wǎng)轉(zhuǎn)載之作品,并不意味著認(rèn)同該作品的觀點(diǎn)或真實(shí)性。如其他媒體、網(wǎng)站或個(gè)人轉(zhuǎn)載使用,請(qǐng)與著作權(quán)人聯(lián)系,并自負(fù)法律責(zé)任。

    3、本網(wǎng)站歡迎積極投稿

    4、聯(lián)系方式:

    編輯信箱:mededit@cdeledu.com

    電話:010-82311666