用于流式分析的樣本種類很多，包括外周血、骨髓穿刺液、骨髓活檢物、組織活檢物、漿膜腔積液、腦脊液、皮膚、黏膜（內(nèi)窺鏡活檢物）、細(xì)針穿刺物等等。樣本的條件控制可能是免疫表型分析質(zhì)控最困難的環(huán)節(jié)之一。每種樣本都有不同的采集、保存、運(yùn)輸和制備要求。首先，觀測樣本外觀：有嚴(yán)重溶血、凝聚或壞死的樣本應(yīng)棄用。

第二，單細(xì)胞懸液的獲?。和庵苎凸撬璐┐桃簽樘烊粏渭?xì)胞懸液；活檢組織常用機(jī)械分離和酶消化兩種方法。不同的實(shí)驗(yàn)要求適用不同的方法。對于需要進(jìn)行膜抗原標(biāo)記的，不僅是要獲得足夠的單細(xì)胞懸液，還要盡量保證細(xì)胞結(jié)構(gòu)的完整性和抗原性，機(jī)械法較適用。只需進(jìn)行細(xì)胞周期或DNA倍體分析的，在機(jī)械法的基礎(chǔ)上加酶消化（如胰蛋白酶、胃蛋白酶等）較適用。

第三，抗凝劑的選擇：外周血標(biāo)本可采用EDTA、ACD或肝素抗凝。如果用同一份血標(biāo)本做白細(xì)胞計(jì)數(shù)和流式分析，則應(yīng)用EDTA抗凝；對于血小板分析的實(shí)驗(yàn)，一般不用肝素抗凝。醫(yī)學(xué)教育|網(wǎng)搜集整理骨髓穿刺液常用肝素或EDTA抗凝。由于相對大量的ACD會通過改變pH而影響骨髓細(xì)胞活性問題，通常不推薦用ACD作骨髓穿刺液的抗凝劑。

第四，樣本的保存：理想狀態(tài)下，樣本應(yīng)在采集后立刻進(jìn)行處理和染色。肝素抗凝的血和骨髓通常可保存至48-72小時(shí)/室溫（16-25）；EDTA抗凝的外周血和骨髓可保存12-24小時(shí)/室溫（16-25）；ACD抗凝的外周血可保存至72小時(shí)/室溫（16-25）；對于只作胞內(nèi)染色的樣本，可固定細(xì)胞以長期保存。但此“固定－染色”的方法取決于要分析的抗原特性和染色方式。

第五，去除紅細(xì)胞的方法：紅細(xì)胞裂解法，操作簡單、快、并最可能保持原始標(biāo)本的白細(xì)胞分布。最好在染色后溶血。若在染色前溶血，需確認(rèn)：（1）抗原性不被溶血過程改變；（2）溶血劑被徹底洗去，細(xì)胞和抗體結(jié)合的動力反應(yīng)未受影響；（3）所用溶血劑不含固定劑，否則會影響細(xì)胞活性及表面標(biāo)記結(jié)果。密度梯度離心法，靶細(xì)胞回收較好并可能得到富集，同時(shí)去除紅細(xì)胞、碎片等，但費(fèi)時(shí)，某些重要細(xì)胞群體可能被選擇性丟失。

第六，細(xì)胞與抗體的比例：廠家推薦的抗體用量通常是假定靶細(xì)胞數(shù)量在5X105 ～1x106范圍內(nèi)。有些標(biāo)本沒有足夠的細(xì)胞，有些則由于細(xì)胞量大，正常濃度下的抗體相對過量或不足，導(dǎo)致假陽性或假陰性結(jié)果。因此，每個(gè)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)根據(jù)不同于廠家推薦的方法，調(diào)整細(xì)胞與抗體用量，得到最適的細(xì)胞/抗體比例。